Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNSTRNQ9Y448 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNSTRNQ9Y448 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms