Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDD3Q9Y3P4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms