Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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