Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PACSIN3Q9UKS6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms