Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD3Q9UJU5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms