Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms