Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VTI1BQ9UEU0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms