Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms