Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms