Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL42Q9P2K6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms