Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP35Q9P2H5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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