Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRBP1Q9P2E9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRBP1Q9P2E9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms