Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms