Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf78Q9NZ63 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms