Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms