Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MEPEQ9NQ76 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms