Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRM3Q9NNZ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms