Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms