Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM6SF1Q9BZW5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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