Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms