Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms