Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP58Q9BVL2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms