Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
THUMPD3Q9BV44 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms