Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms