Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms