Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX22Q96L94 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms