Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC34Q96HJ3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms