Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms