Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM52Q96A61 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM52Q96A61 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms