Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC1Q969X5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC1Q969X5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms