Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFRP1Q8N474 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFRP1Q8N474 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms