Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms