Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD2Q6Y1H2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD2Q6Y1H2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms