Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CASC2Q6XLA1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms