Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF7Q6Q0C0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms