Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
UFSP1Q6NVU6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UFSP1Q6NVU6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms