Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHYHD1Q5SRE7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms