Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITRM1Q5JRX3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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