Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms