Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CCDC96Q2M329 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CCDC96Q2M329 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC96Q2M329 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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