Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C17orf58Q2M2W7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms