Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDS5AQ29RF7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms