Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q1T7F1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q1T7F1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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