Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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