Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRNQ16849 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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PTPRNQ16849 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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