Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UPP1Q16831 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms