Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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NDUFA9Q16795 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA9Q16795 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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