Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCBQ16143 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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