Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX1Q15699 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX1Q15699 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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