Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRADDQ15628 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRADDQ15628 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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